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주식 양도소득 기본공제 누락분 반영 환급 안내

작성자: 삼일아이닷컴 | Nov 10, 2026, 1:19:16 AM

 국세청은 2021~2025년 귀속 주식 양도소득세 신고내용을 검토한 후
기본공제를 누락하여 세금을 더 낸 납세자 4,687명에게 21억 원(1인당 최대 79만 원)을
11월 3일(화) 환급하였다고 밝혔습니다.
 (출처: 국세청) 
 
□ 양도소득 기본공제는 과세표준을 계산할 때 세법(「소득세법」 제103조)에 따라 공제되는 항목이므로 국세청은 납세자가 별도로 환급을 신청하지 않았더라도 주식 양도소득세 신고내용을 직접 확인하여 기본공제 누락분 250만원을 반영한 후 환급하였다. [하단 참고]
 
[환급사례] A씨는 2024년 귀속분 주식 양도소득 600만원을 세율 30%로 예정신고하였으나, 기본공제를 누락하여 세액 180만원을 납부함▶기본공제 250만원을 반영한 후 경정감하여 세액 105만원(350만원×30%)으로 감소▶79만원(환급가산금 4만원 포함) 돌려받음
 
□ 주식 양도소득세 신고는 반기별 예정신고(국내주식)와 확정신고*(국외주식, 양도손익 통산 등)를 거쳐야 하므로 납세자가 이해하기 복잡한 측면이 있다.
* 국내주식을 2회 이상 양도하고 소득금액을 합산 신고하지 않은 경우 확정신고를 해야 하며, 국외주식 신고와 국내･국외주식의 양도손익 통산은 확정신고 시에만 가능하다.
〇 따라서, 그동안 국세청은 신고 안내와 도움자료 제공 등을 통해 납세자의 성실신고를 적극적으로 지원해 왔다.
〇 그러나, 주식 양도소득세 신고 시에 기본공제가 적용된다는 점을 몰랐거나 착오 등으로 신고 과정에서 기본공제를 누락한 후 세금을 더 낸 사례가 다수 확인되었고, 관련 경정청구(더 낸 세금을 돌려달라는 신청) 건수는 적은 것으로 나타남에 따라 납세자 권익을 보호하기 위해 환급을 추진하였다.
 
□ 국세환급금통지서는 환급 대상자에게 모바일 또는 우편으로 발송*되며 홈택스(손택스)의 ‘환급금 상세조회’에서 환급금 유무와 금액을 확인할 수 있고 이미 지급된 환급금과 아직 받지 못한 환급금도 조회할 수 있다.
* 계좌 지급 대상자는 모바일로, 현금 지급 대상자에게는 우편으로 통지서를 발송한다.
 
국세청은 주식 양도소득세 환급을 이유로 계좌 비밀번호, 카드번호, 인터넷 뱅킹 정보 등을 요구하거나 송금을 요청하지 않는다. 전자금융 범죄가 의심되는 경우 경찰청(☎112), 금융감독원(☎1332), 한국인터넷진흥원(☎118)에 즉시 신고하기 바란다.
 
〇 국세청에 이미 신고된 환급계좌가 있으면 별도의 지급신청 없이 해당 계좌로 입금되며, 신고된 계좌가 없으나 환급금을 계좌로 입금받으려면 홈택스의 ‘환급금 상세조회’에서 [지급신청]을 선택하고 본인 명의 계좌를 입력하여 신청하면 된다.
〇 환급금을 계좌로 입금받기 어려운 경우, 국세환급금통지서와 신분증을 가지고 우체국에서 현금으로 받을 수 있으며, 신고된 환급계좌가 없는 현금 지급 대상자는 홈택스에서 국세환급금통지서를 재출력할 수 있다.
 
접근
경로
  
⇒ [홈택스] → 납부･고지･환급금 → 환급금 상세조회
[손택스] → 전체메뉴(오른쪽 상단) → 납부･고지･환급금→ 국세환급 → 환급금 상세조회

[참고] 기본공제 반영에 따른 환급세액 계산 사례
※ 주식 양도소득 기본공제를 누락하고 다른 주식의 양도차손이나 감면ㆍ세액공제가 없는 사례로 기본공제 반영 전후 세액을 비교함
 
〇 (환급사례) 기본공제 반영에 따른 양도소득세 환급
- A씨는 2024년 귀속 중소기업이 아닌 비상장법인 주식(보유기간 1년 미만, 세율 30% 적용)을 양도하고 예정신고를 한 대주주이다. 양도소득금액 600만 원에 기본공제를 적용하지 않아 양도소득세 180만 원을 납부하였다.
- 기본공제 250만 원을 반영하면 양도소득세 786,110원을 돌려받는다.
구분
기본공제 미반영
기본공제 반영 후
ㆍ① 양도소득금액
6,001,449원
6,001,449원
ㆍ② 기본공제액
-
2,500,000원
ㆍ③ 과세표준(①-②)
6,001,449원
3,501,449원
ㆍ④ 적용 세율
30%
30%
ㆍ⑤ 양도소득세(③×④)
1,800,434원
1,050,434원
ㆍ⑥ 환급금(본세)
  
750,000원
ㆍ⑦ 국세환급가산금
  
36,110원
ㆍ⑧ 환급세액(기납부 세액-⑤+⑦)
-
786,110원
* 국세환급가산금 : 750,000원 × 연3.1% × 567일/365일 = 36,110원
 
※ 과다 납부한 세액의 납부일 ’25.4.11. 국세환급금 지급결정일 ’26.10.30.경과 기간은 납부일의 다음 날부터 지급결정일까지 567일(’25.4.12.~’26.10.30.)
 
 
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